Protein–RNA interactions for Protein: P40197

GP5, Platelet glycoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP5P40197 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GP5P40197 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GP5P40197 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GP5P40197 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GP5P40197 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms