Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms