Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GJC1P36383 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GJC1P36383 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GJC1P36383 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJC1P36383 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms