Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXD12P35452 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms