Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJA4P35212 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJA4P35212 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms