Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP6P35125 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP6P35125 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP6P35125 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP6P35125 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP6P35125 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP6P35125 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms