Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ECHS1P30084 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms