Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD40LGP29965 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD40LGP29965 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms