Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GJB2P29033 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GJB2P29033 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms