Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YY1P25490 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
YY1P25490 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
YY1P25490 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
YY1P25490 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
YY1P25490 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YY1P25490 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
YY1P25490 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YY1P25490 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YY1P25490 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YY1P25490 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YY1P25490 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YY1P25490 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
YY1P25490 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YY1P25490 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
YY1P25490 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms