Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTAFRP25105 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms