Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNCP24821 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNCP24821 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNCP24821 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNCP24821 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNCP24821 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNCP24821 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNCP24821 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNCP24821 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNCP24821 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNCP24821 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms