Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRBP23467 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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