Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA6P23229 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms