Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFNA1P20827 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms