Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRHP20396 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRHP20396 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRHP20396 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRHP20396 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRHP20396 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRHP20396 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRHP20396 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms