Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC9A1P19634 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC9A1P19634 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms