Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TNNI3P19429 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms