Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD53P19397 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD53P19397 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD53P19397 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms