Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN1P18031 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTPN1P18031 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms