Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXB4P17483 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms