Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAV1P15498 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAV1P15498 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAV1P15498 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms