Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HLA-EP13747 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-EP13747 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HLA-EP13747 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-EP13747 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-EP13747 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HLA-EP13747 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms