Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VPREB1P12018 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms