Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCF2P10911 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MCF2P10911 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MCF2P10911 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms