Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GLI3P10071 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GLI3P10071 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GLI3P10071 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GLI3P10071 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GLI3P10071 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms