Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMIM10L2BP0DMW5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMIM10L2BP0DMW5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms