Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CT47B1P0C2W7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CT47B1P0C2W7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms