Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEFLP07196 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEFLP07196 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms