Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGAVP06756 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGAVP06756 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms