Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms