Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRPM2O94759 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPM2O94759 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms