Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEBLO76041 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEBLO76041 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NEBLO76041 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NEBLO76041 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms