Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SKAP2O75563 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms