Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA4O75335 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PPFIA4O75335 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms