Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMARCA5O60264 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMARCA5O60264 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms