Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP9BO43861 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP9BO43861 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms