Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PHF1O43189 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PHF1O43189 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PHF1O43189 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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