Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLOCKO15516 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms