Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
POLR1CO15160 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR1CO15160 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms