Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3AO14802 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3AO14802 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms