Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KPNA3O00505 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KPNA3O00505 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms