Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms