Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPBD1B2RD01 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms