Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPIPB13A6NJU9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms