Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM221AA4D161 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms