Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGKV1-27A0A075B6S5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms