Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PARP3Q9Y6F1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms