Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFE2L3Q9Y4A8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms