Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR1DQ9Y2S0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms